Karoq, Kodiaq'ın ardından 2017 yılında yeni kriterler ışığında Euro NCAP'ten 5 yıldız alan ikinci Skoda modeli oldu. Skoda, böylelikle "tüm modelleriyle" 5 yıldızlı güvenlik sunan sayılı markalar arasındaki yerini de aldı. Skoda Karoq, Euro NCAP çarpma testlerinde, "yetişkin yolcuları" yüzde 93 oranında koruyarak mükemmel bir başarı elde ederken, arkadan çarpmalarda da aracın boyun kısmının korunması konusundaki başarısı da not edildi. Karoq'un "Acil Frenleme Sistemi", şehir içindeki düşük hızlarda başarıyla çalışarak, testlerde neredeyse tüm kazaların önüne geçti. Euro NCAP ayrıca, çarpma anında yayaların bacaklarının korunması konusunda da Karoq'a "tam puan" verirken, araç, kaza anında yine yayaların baş kısımlarını da en iyi şekilde koruyor.